- A TP53 a legismertebb tumorszuppresszor gén, termékét, a p53 fehérjét a genom őrének is nevezik.
- A p53 fehérje különböző sejtkárosodásra adott válaszban játszik szerepet, szabályozza többek között a sejtciklust, az apoptózist, a sejtöregedést, a DNS javítást, illetve a metabolizmust.
- A malignus betegségek kb. 50%-ban fordul elő eltérés a TP53 génben.
- A 32,8 kb hosszúságú gén mind a 11 exonjában előfordulhatnak patogén mutációk.
- Az iwCLL (Nemzetközi CLL Munkacsoport) valamennyi krónikus lymphocytás leukémiás beteg esetében terápia előtt TP53 mutációanalízist javasol.
Krónikus lymphocytás leukémia
- A krónikus lymphocytás leukémia (CLL) a leggyakoribb felnőttkori leukémia, genetikailag heterogén betegség.
- A diagnóziskor a betegek 4-7%-ában mutatható ki TP53 mutáció, terápia-refrakter esetekben ez az arány 40-50% is lehet.
- CLL esetében a legfontosabb prognosztikus és prediktív genetikai eltérés a TP53 mutáció; kedvezőtlen kórlefolyással, és a kemoimmunoterápia sikertelenségével társul.
- Az iwCLL (Nemzetközi CLL Munkacsoport) valamennyi krónikus lymphocytás leukémiás beteg esetében terápia előtt TP53 mutációanalízist javasol.
Akut leukémiák
- Az akut myeloid leukémia (AML) és az akut lymphoblastos leukémia (ALL) rossz prognózisú, nagy malignitású, genetikailag heterogén betegség felnőttkorban.
- TP53 eltérés az akut leukémiák 5-15%-ában fordul elő, kedvezőtlen kórlefolyással társul.
- Minden AML és ALL esetében javasolt a TP53 mutációanalízis elvégzése.
KAPCSOLAT
+36 70 674 6611
PROJEKT SZERVEZÉSE
project egyeztetés, szoftverdemo, árajánlat, szerződés, szervezés
MINTABEKÜLDÉS
FFPE blokk, vagy metszet, sejtblokk, vagy kenet, vagy izolált DNS
EREDMÉNYKÖZLÉS
nemzetközi standardok alapján a variánsok kategorizálása (patogén, valószínű patogén, VUS stb.)
GENETIKAI ELEMZÉS
bioinformatikai elemzés, variánsok azonosítása és annotálása
SZÖVETTANI FELDOLGOZÁS
mikroszkópos tumorsejt-ellenőrzés, DNS-izolálás
Módszer
- Izolált genomiális DNS-ből, vagy EDTA-s csontvelői aspiratum/perifériás vérmintából, szükség esetén formalinban fixált, paraffinba ágyazott (FFPE) blokkból.
- Szükséges tumorsejt arány: ≥20%
- TP53 gén teljes kódoló és 3’/5’ UTR régióinak szekvenálása.
- Egyedi nukleotid variánsok (SNV), rövid inszerciók és deléciók azonosítása bioinformatikai módszerekkel.
- Az azonosított variánsok osztályozása és annotációja (ClinVar, COSMIC, HGMD, IARC TP53, stb).
LEFEDETTSÉG
>95% (>500×)
ÁTLAGOS MÉLYSÉG
>1000×
ÁTFUTÁSI IDŐ
2-3 hét
